Mówi się, że każda dieta, jeżeli ma przynieść pożądany efekt, musi być połączona z aktywnością fizyczną. W dużej mierze jest to prawda, chociaż dr Pierre Dukan, twórca kuracji proteinowej ma odmienne zdanie. Nie odradza on aktywności fizycznej w ogóle, ale radzi, by w czasie fazy uderzeniowej, czyli przez pierwsze dwa etapy kuracji Protal nie stosować nadmiernej aktywności fizycznej. Wychodzi on bowiem z założenia, że przez ten pierwszy okres, kiedy organizm jest osłabiony dość radykalna zmianą w menu, aktywność fizyczna mogłaby doprowadzić do nadmiernego jego osłabienia. Po drugie, ponieważ dieta ta wymaga wiele determinacji, by ją przejść nie odpuszczając sobie ani na chwilę, aktywność fizyczna mogłaby dodatkowo zniechęcić osoby, które ją stosują. Dieta ta o wiele lepiej skutkuje, jeśli połączy się ją z dużą ilością snu i wypoczynku. Musimy mieć bowiem wiele energii, aby móc jej podołać. Aktywność fizyczna jest jednak jak najbardziej wskazana wtedy, kiedy dieta wchodzi na trzecią fazę, czyli fazę utrwalania.